＜NEW＞研修期間が基幹施設6か月未満、または連携施設1箇所につき3か月（選択研修の場合は1か月）未満となる場合の理由書は、専攻医ごとに提出する必要があるでしょうか。また、いつ提出すれば良いでしょうか。｜一般社団法人日本専門医機構 総合診療専門医検討委員会

いいえ、プログラムの立て付けの問題であれば、専攻医ごとではなく、プログラム毎に一度だけ提出して下さい。この場合、プログラムの変更がない限り再提出は不要です。
但し、専攻医個人の都合によるものであれば、専攻医ごとの提出が必要になります。
理由書の提出はプログラム申請期間中（4～5月）と年度途中の1月頃に受け付けます。詳細に関しては「お問い合わせ」フォームよりご連絡ください。

※参考：基幹施設6か月、連携施設3か月（選択研修の場合は1か月）未満の理由書